ดร.พัชราวดี ทองคำคูณ

Patcharawadee Thongkumkoon, Ph.D.

Contact Information

Patcharawadee Thongkumkoon, Ph.D.

Email  :  Patcharawadee.t@cmu.ac.th

Address  :  Center of Multidisciplinary Technology for Advanced Medicine (CMUTEAM), 9th floor – The 50th Anniversary Building, Faculty of medicine, Chiang Mai University

Research Interests

I’m interested in integrating OMICs data, such as genome sequencing and transcriptome analysis, to identify biomarkers and actionable target drugs for cancer research. Moreover, I have created a research study that utilizes multi-OMIC approaches, including long-read genome sequencing, cell-free DNA sequencing, and metabolomic profiling, to diagnose and monitor acute leukemia patients. These advancements are expected to bring significant benefits to healthcare and research.

Expertise

  • Bioinformatics analysis in cancer research
  • rare disease
  • pharmacogenomics
  • microbiota

Biography

Education

Ph.D.  :  2013 – 2019
Doctor of Philosophy (Science), Faculty of Sciences, Chiang Mai University, Thailand.

M.S.  :  2005 – 2008
Master of Science, Faculty of Science, Chiang Mai University, Chiang Mai, Thailand.

B.S.  :  2001 – 2005
Bachelor of Science in Biology, Faculty of Science, Chiang Mai University, Chiang Mai, Thailand.

Current Projects

  • การใช้เทคโนโลยีทางอณูพันธุศาสตร์และเซลล์พันธุศาสตร์ในการวินิจฉัยรคทางพันธุกรรมในโรงพยาบาลมหาราชนครเชียงใหม่
  • การบูรณาการสารการวิเคราะห์ Liquid Biopsy เพื่อการวินิจฉัยและการจัดการมะเร็งแบบไม่รุกราน
  • การวิเคราะห์การกลายพันธุ์ก่อโรคมะเร็งในผู้ป่วยกลุ่มโรคลีฟราวเมนีซินโดรมคนไทย
  • การศึกษาการกลายพันธุ์เจิร์มไลน์และพัฒนาชุดตรวจหาพันธุกรรมสำหรับกลุ่มโรคมะเร็งที่ถ่ายทอดทางพันธุกรรมในผู้ป่วยคนไทย
  • การวิเคราะห์เปรียบเทียบและการสร้างฐานข้อมูลจีโนมของเชื้อลิชมาเนียสายพันธุ์ท้องถิ่นที่เกี่ยวข้องกับการดื้อยา เชื้อไวรัสที่อาศัยร่วม และแมลงพาหะ เพื่อการรักษา การป้องกันและควบคุมโรคลิชมาเนียอุบัติใหม่ในประเทศไทย อย่างมีประสิทธิภาพ
  • เภสัชพันธุศาสตร์ของยา clozapine ด้านอาการไม่พึงประสงค์จากยาในผู้ป่วยจิตเภท
  • Influence of genetic polymorphisms and gut microbiota on tacrolimus blood concentration and clinical outcomes in Thai kidney transplant recipients
  • ผลของถั่วเน่าต่อการป้องกันการเกิดโรคที่เกี่ยวกับความชรา
  • การเปลี่ยนแปลงของไมโครไปบโอต้า สารอาหาร และสารไอโซฟลาโวนในถั่วเน่า
  • การผลิตสารออกทธิ์เชิงหน้าที่จากผักพื้นบ้านเพื่อใช้ในการพัฒนาผลิตภัณฑ์อาหารสุขภาพล้านนาสำหรับป้องกันโรคไม่ติดต่อเรื้อรัง
  • การปรับตัวทางพันธุกรรมต่อการคัดเลือกในสภาพพื้นที่สูงและป่าดิบชองกลุ่มชาวไทยภูเขา
  • นวัตกรรมข้าวเหนียว และข้าวญี่ปุ่นจากเทคโนโลยีลำไอออนเพื่อชาวนาในภาคเหนือ

Research & Publications

Research Interests :

I’m interested in integrating OMICs data, such as genome sequencing and transcriptome analysis, to identify biomarkers and actionable target drugs for cancer research. Moreover, I have created a research study that utilizes multi-OMIC approaches, including long-read genome sequencing, cell-free DNA sequencing, and metabolomic profiling, to diagnose and monitor acute leukemia patients. These advancements are expected to bring significant benefits to healthcare and research.

Publications :

  1. Dukaew, N., Thongkumkoon, P., Sirikaew, N., Dissook, S., Sakuludomkan, W., Tongjai, S., … & Koonrungsesomboon, N. 2023. Gut Microbiota-Mediated Pharmacokinetic Drug–Drug Interactions between Mycophenolic Acid and Trimethoprim-Sulfamethoxazole in Humans. Pharmaceutics, 15(6), 1734.
  2. Udomruk S, Phanphaisarn A, Kanthawang T, Sangphukieo A, Sutthitthasakul S, Tongjai S, Teeyakasem P, Thongkumkoon P, et al. 2023. Characterization of Cell-Free DNA Size Distribution in Osteosarcoma Patients. Clinical Cancer Research
  3. Thongkumkoon P, Chomdej S, Kampuansai J, et al. Genetic assessment of three Fagaceae species in forest restoration trials. PeerJ 2019; 7:e6958.
  4. Waikham P, Thongkumkoon P, Chomdej S, Liu AZ, and Wangpakapattanawong P. 2018. Development of Microsatellite Markers for Castanopsis tribuloides (Fagaceae) Using Next Generation Sequencing. Molecular Biology Reports. 45(1): 27-30.
  5. Mahadtanapuk S, Teraarusiri W, Nanakorn W, Yu L, Thongkumkoon P, Anuntalabhochai S (2014) A novel ion-beam-mutation effect application in identification of gene involved in bacterial antagonism to fungal infection of ornamental crops. Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Section B: Beam Interactions with Materials and Atoms, 326, 209-213.
  6. Thongkumkoon P, Sangwijit K, Chaiwong C, Thongtem S, Singjai P, Yu L (2014) Direct nanomaterial-DNA contact effects on DNA and mutation induction. Toxicol Lett, 226, 90-97.
  7. Yu L, Sanwijit K, Prakrajang K, Phanchaisri B, Thongkumkoon P, Thopan P, Singkarat S, Anuntalabhochai S (2014) Mechanisms of ion-bombardment-induced DNA transfer into bacterial E. coli cells. Nuclear Instruments and methods in Physics Research Section B: Beam Interactions with Materials and Atoms. 326, 204-208.
  8. Jaichuen C, Chundet R, Yu L, Thongkumkoon P, Anuntalabhocahi S (2013) Investigation of effect from low-energy plasma immersion ion bombardment of extracellular DNA and gene fragment on mutation induction. Surf Coat Technol, 229, 180-185.
  9. Thongkumkoon P, Prakrajang K, Thopan P, Yaopromsiri C, Suwannakachorn D, Yu L (2013) Is low-energy-ion bombardment generated X-ray emission a secondary mutational source to ion-beam-induced genetic mutation? Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Section B: Beam Interactions with Materials and Atoms, 307, 592-597.
  10. Thopan P, Prakrajang K, Thongkumkoon P, Suwannakachorn D, Yu L (2013) An ion beam deceleration lens for ultra-low-energy ion bombardment of naked DNA. Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Section B: Beam Interactions with Materials and Atoms, 307, 618-623.
  11. Wongkham W, Sririwichitchai R, Inthanon K, Puangwanna T, Nambuddee M, Thongkumkoon P, Prakrajang K, Yu L (2013) Low-energy ion beam bombardment of human cancer cells in vacuum to induce DNA transfection. Vacuum, 90, 89-96.
  12. Yu L, Wongkham W, Prakrajang K, Sangwijit K, Inthanon K, Thongkumkoon P, Wanichapichart P, Anuntalabhochai S (2013) Nano-ranged low-energy ion-beam-induced DNA transfer in biological cells. Appl Surf Sci, 275, 136-141.
  13. Jaichuen C, Chundet R, Yu L, Thongkumkoon P, Anuntalabhochai S (2012) Effect on Genetic Mutation Induction from Nano-Ranged Low-Energy Plasma Ion Bombardment of DNA and Gene Fragment. Proceedings of the International Conference Nanomaterials: Applications and Properties, 02NNBM13.
  14. Sarapirom S, Thongkumkoon P, Prakrajang K, Anuntalabhochai S, Yu L (2012) A comparative study on low-energy ion beam and neutralized beam modifications of naked DNA and biological effect on mutation. Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Section B: Beam Interactions with Materials and Atoms, 272, 377-381.
  15. Sarapirom S, Thongkumkoon P, Anuntalabhochai S, Yu L (2011) Vacuum effect on DNA lesion and genetic mutation of cells. Vacuum, 86, 374-379.

Contact Us

Address  : 9th floor – The 50th Anniversary Building, Faculty of Medicine, Chiang Mai University, 110 Intawaroros Road, Si Phum, Muang, Chiang Mai 50200

Email Patcharawadee.t@cmu.ac.th

Organizations  :  Center of Multidisciplinary Technology for Advanced Medicine (CMUTEAM)